Я пытаюсь установить пакет для rnaseq под названием ЗВЕЗДА в контейнере докера, использующем ubuntu:16.04.
После загрузки его и распакованный он я скомпилировал его после документа:
# Compile
cd STAR/source
make STAR
Независимо для немногих предупреждений кажется, что сборка проходит.
Но Если я ввожу:
STAR
bash: STAR: command not found
Все же, поиск его:
apt list --installed | grep "STAR"
никакой вывод...
Если я пытаюсь перекомпилировать:
make STAR
make: 'STAR' is up to date.
Где мой пакет закончился? Какая-либо справка?
Обычно, необходимо дать команду make install
или подобный, чтобы, ну, в общем, установить пакет в Вашей системе.
Кроме того, обычно снова это будет гибнуть /usr/local/
который не мог бы быть в Вашем $PATH
, таким образом, необходимо проверить документацию более тщательно.
Если Вы надеетесь создавать a .deb
пакет, проверьте dpkg-buildpackage
команда от dpkg-dev
, с которым можно установить
sudo apt-get install dpkg-dev
Таким образом, можно затем использовать dpkg -i generated_package_name.deb
для установки в системе, и это появится в dpkg --list
и apt list --installed
вывод.