Так в основном я устанавливаю свой портфель и панель птеродактиля на моем веб-сайте, теперь ничто не работает

Это появляется Вы случайно измененные полномочия для Вашего /var/www каталог. Необходимо будет установить верные полномочия для www-data в файлы доступа в Вашем /var/www каталог.

1. Измените владение группы/var/www и его содержания апачской группе.

   sudo chown -R www-data:www-data /var/www
   

2. Чтобы добавить полномочия записи группы и установить идентификатор группы на будущих подкаталогах, измените полномочия каталога/var/www и его подкаталогов.

   sudo chmod 2775 /var/www
   find /var/www -type d -exec sudo chmod 2775 {} \;
   

3. Для добавления полномочий записи группы рекурсивно измените полномочия файла/var/www и его подкаталогов:

   find /var/www -type f -exec sudo chmod 0664 {} \;