Эта проблема сразу не появилась после установки VLC от repos в Kubuntu 18.04, но через некоторое время.
Запуск VLC и использование его внутренних действий GUI (Открытый файл и т.д.) работы.
Выполнение vlc path/to/file
работы.
После установки VLC как значение по умолчанию для типа файла и выполнения это или использующий "Открытый с" из контекстного меню дельфина, VLC запускается, но сразу закрывается.
Если VLC уже работает при выполнении файла или использовании "Открытый с" из контекстного меню дельфина, файл играется как ожидалось.
Я могу рекомендовать очистить папки VLC, такой как
~/.config/vlc
~/.cache/vlc
~/.local/share/vlc