Панель Gnome становится полностью прозрачной, когда окно не максимизируется!

поведение в Вашем вопросе от темы пользовательской оболочки.

необходимо искать ниже значений в таблице стилей, которую Вы используете в качестве темы пользовательской оболочки.

#panel ->>, когда никакое окно не максимизируется.
#panel.solid ->>, когда окно максимизируется.

в ниже примера я взял /usr/share/gnome-shell/theme/ubuntu.css файл в моей Ubuntu 18.04

в номере строки 658

/* TOP BAR */
#panel {
  background-color: rgba(0, 0, 0, 0.2);
  /* transition from solid to transparent */
  transition-duration: 500ms;
  font-weight: bold;
  height: 1.86em; }

и в номере строки 1950

/* panel color */
#panel.solid {
  background-gradient-direction: vertical;
  background-gradient-start: #58554d;
  background-gradient-end: #3f3e39;
  text-shadow: 0px 0px 2px rgba(0, 0, 0, 0.9);
}

Измененный на

/* TOP BAR */
#panel {
  background-color: green;
  /* transition from solid to transparent */
  transition-duration: 500ms;
  font-weight: bold;
  height: 1.86em; }

и

/* panel color */
#panel.solid {
  background-gradient-direction: vertical;
  background-gradient-start: blue;
  background-gradient-end: blue;
  text-shadow: 0px 0px 2px rgba(0, 0, 0, 0.9);
}

так как я изменил цвета на зеленый и синий цвет в вышеупомянутом. Я должен рассматривать главную панель как цвет Green, когда никакое окно не максимизируется. и Синий цвет, когда окно максимизируется.

вот некоторые снимки экрана.