У меня была такая же проблема после удаления iBus. Удаление ibus решило проблему изменения настроек языка клавиатуры, а также удалило значки из меню настроек системы. Поэтому я переустановил ibus, и теперь я вернулся к квадрату с меняющимися языками клавиатуры, но с полным меню настроек :-)
Команда sleep - хороший способ добавить задержку (поэтому в моем примере - 60 секунд), затем удваивает амперсанд и запускает дополнительную команду, когда сон закончил.
sleep 60 && xdotool key Page_Up
sleep 60 && xdotool key Page_Down
XDO предназначен для имитации keypresses в X11, не уверен, как глубже вы можете перейти с терминала, не создавая собственное приложение, чтобы напрямую манипулировать X11 apis.