Если вы имеете в виду установку набора приложений (в основном gui), установленных по умолчанию в Desktop Edition, но не Server Edition, просто установите пакет ubuntu-desktop.
После небольшого разговора я нашел два файла в ~/.config/dconf: user с размером 0 байт и user.H37S4 с нормальным размером несколько kB.
Удаление файла user и переименование user.H37S4 -> user не только исцелило реестр, но и восстановило настройки в их предыдущем состоянии.
мы изменили эти файлы под виртуальным терминалом, когда выходим из единства и всей графической среды рабочего стола.