Unison настаивает на том, чтобы иметь точно такую же версию на обоих концах соединения. Каждая версия зависит от конкретной версии системных библиотек C. Поэтому, если у ОДНОЙ из машин, на которых вы работаете, есть старая версия этих библиотек, вы должны использовать соответствующую старую версию Unison для всех используемых вами машин.