Нет. Boot-Repair не может перезаписать загрузчик Windows. Он может установить только загрузчик GRUB, который вызовет загрузчик Windows.
Мое беспокойство заключается в том, что если я запустил Boot Repair, он перезапишет мой загрузчик Windows?
Должен ли я запустить Boot Repair с отключенным диском Windows?