ЦП трудный тупик с сервером Ubuntu 14.04 на машине AMD

У меня есть следующая конфигурация рабочей станции с 64 ядрами: 4x Поршень AMD Athlon 6378 2.4 ГГц 128 ГБ Супермикро материнская плата H8QGI-F-O SDD на 2 x 512 ГБ Samsung с программным обеспечением RAID 0 установок

Я работаю, Ubuntu разъединяют 14.04. Я получал следующую ошибку для всех ядер сервера человечности, которые я попробовал (3.13.0-32 до 3.13.0-45). Я выполняю молекулярное моделирование динамики при выполнении его больше чем на 20 процессорах, машина значительно замедляется в какой-то степени замораживания (сообщения об ошибках из /var/log/kern.log, отправленного ниже). Это работает очень хорошо при выполнении всего одного экземпляра программы... нет никакой проблемы с пакетом программ моделирования, я выполнил его на различных серверах в 64 копиях, и это работало очень хорошо. Я также загрузил CentOS 7 и Ubuntu 12.04 от LiveCD на моей машине и выполнил 64 экземпляра кода, и это никогда не замедлялось / заморозился. Ubuntu 12.04 с ядром 13.0.-32 запустила программное обеспечение очень хорошо от начальной загрузки LiveCD, но всегда замораживалась с моей установкой сервера Ubuntu 14.04. Это могло быть возможно вызвано некоторыми загруженными модулями в ядре? Я попробовал memtest (без проблем), и также выделение компьютера с выполнением 64 копий cpuburn, все хорошо работали, таким образом, это кажется как специфическая ошибка. Любая справка / совет, как настроить мою установку Ubuntu 14.04, чтобы заставить его работать безупречно без тупика CPU, значительно ценится!

Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746081] WARNING: CPU: 59 PID: 4337 at /build/buildd/linux-3.13.0/kernel/watchdog.c:245 watchdog_overflow_callback+0x9c/0xd0()
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746084] Watchdog detected hard LOCKUP on cpu 59
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746086] Modules linked in: rfcomm bnep bluetooth binfmt_misc kvm_amd kvm crct10dif_pclmul crc32_pclmul ghash_clmulni_intel aesni_intel aes_x86_64 lrw gf128mul glue_helper ablk_helper cryptd serio_raw amd64_edac_mod edac_core fam15h_power k10temp edac_mce_amd nvidia(POX) sp5100_tco i2c_piix4 drm shpchp joydev mac_hid parport_pc ppdev lp parport pata_acpi hid_generic usbhid hid raid10 raid456 async_raid6_recov async_memcpy async_pq async_xor async_tx xor raid6_pq raid1 raid0 multipath igb linear i2c_algo_bit psmouse dca ahci ptp pata_atiixp libahci pps_core
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746140] CPU: 59 PID: 4337 Comm: xargs Tainted: P           OX 3.13.0-45-generic #74-Ubuntu
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746143] Hardware name: Supermicro H8QG6/H8QG6, BIOS 3.5        12/16/2013
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746145]  0000000000000009 ffff882066d65c38 ffffffff81720eb6 ffff882066d65c80
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746174]  ffff882066d65c70 ffffffff810677cd ffff88203a840000 0000000000000000
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746187]  ffff882066d65d88 0000000000000000 ffff882066d65ef8 ffff882066d65cd0
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746201] Call Trace:
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746203]    [] dump_stack+0x45/0x56
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746220]  [] warn_slowpath_common+0x7d/0xa0
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746226]  [] warn_slowpath_fmt+0x4c/0x50
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746233]  [] ? restart_watchdog_hrtimer+0x50/0x50
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746239]  [] watchdog_overflow_callback+0x9c/0xd0
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746246]  [] __perf_event_overflow+0x8e/0x240
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746254]  [] ? ioremap_page_range+0x241/0x320
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746260]  [] perf_event_overflow+0x14/0x20
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746267]  [] x86_pmu_handle_irq+0x144/0x190
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746275]  [] ? unmap_kernel_range_noflush+0x11/0x20
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746282]  [] perf_event_nmi_handler+0x2b/0x50
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746288]  [] nmi_handle.isra.3+0x88/0x180
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746294]  [] do_nmi+0x169/0x340
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746299]  [] end_repeat_nmi+0x1e/0x2e
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746307]  [] ? __write_lock_failed+0x13/0x20
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746312]  [] ? __write_lock_failed+0x13/0x20
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746317]  [] ? __write_lock_failed+0x13/0x20
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746319]  >  [] _raw_write_lock_irq+0x1e/0x20
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746330]  [] do_exit+0x5a9/0xa50
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746336]  [] do_group_exit+0x3f/0xa0
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746341]  [] SyS_exit_group+0x14/0x20
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746348]  [] system_call_fastpath+0x1a/0x1f
Jun 12 10:40:15 vochomurka kernel: [  233.746350] ---[ end trace 04f618100e4ac70c ]---
Jun 12 10:40:29 vochomurka kernel: [  251.810867] pbs_sched[2739]: segfault at 0 ip 00007fc20f1927fc sp 00007fff726e1d50 error 4 in libtorque.so.2.0.0[7fc20f180000+2c000]
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822760] ------------[ cut here ]------------
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822775] WARNING: CPU: 59 PID: 4360 at /build/buildd/linux-3.13.0/kernel/watchdog.c:245 watchdog_overflow_callback+0x9c/0xd0()
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822777] Watchdog detected hard LOCKUP on cpu 59
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822779] Modules linked in: rfcomm bnep bluetooth binfmt_misc kvm_amd kvm crct10dif_pclmul crc32_pclmul ghash_clmulni_intel aesni_intel aes_x86_64 lrw gf128mul glue_helper ablk_helper cryptd serio_raw amd64_edac_mod edac_core fam15h_power k10temp edac_mce_amd nvidia(POX) sp5100_tco i2c_piix4 drm shpchp joydev mac_hid parport_pc ppdev lp parport pata_acpi hid_generic usbhid hid raid10 raid456 async_raid6_recov async_memcpy async_pq async_xor async_tx xor raid6_pq raid1 raid0 multipath igb linear i2c_algo_bit psmouse dca ahci ptp pata_atiixp libahci pps_core
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822832] CPU: 59 PID: 4360 Comm: pbs_iff Tainted: P        W  OX 3.13.0-45-generic #74-Ubuntu
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822834] Hardware name: Supermicro H8QG6/H8QG6, BIOS 3.5        12/16/2013
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822837]  0000000000000009 ffff882066d65c38 ffffffff81720eb6 ffff882066d65c80
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822870]  ffff882066d65c70 ffffffff810677cd ffff88203a840000 0000000000000000
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822893]  ffff882066d65d88 0000000000000000 ffff882066d65ef8 ffff882066d65cd0
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822911] Call Trace:
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822913]    [] dump_stack+0x45/0x56
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822931]  [] warn_slowpath_common+0x7d/0xa0
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822936]  [] warn_slowpath_fmt+0x4c/0x50
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822943]  [] ? restart_watchdog_hrtimer+0x50/0x50
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822949]  [] watchdog_overflow_callback+0x9c/0xd0
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822956]  [] __perf_event_overflow+0x8e/0x240
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822964]  [] ? ioremap_page_range+0x241/0x320
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822970]  [] perf_event_overflow+0x14/0x20
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822978]  [] x86_pmu_handle_irq+0x144/0x190
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822985]  [] ? unmap_kernel_range_noflush+0x11/0x20
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822993]  [] perf_event_nmi_handler+0x2b/0x50
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.822998]  [] nmi_handle.isra.3+0x88/0x180
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823004]  [] do_nmi+0xd0/0x340
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823009]  [] end_repeat_nmi+0x1e/0x2e
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823017]  [] ? kzfree+0x2d/0x30
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823024]  [] ? __write_lock_failed+0x13/0x20
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823030]  [] ? __write_lock_failed+0x13/0x20
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823035]  [] ? __write_lock_failed+0x13/0x20
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823037]  >  [] _raw_write_lock_irq+0x1e/0x20
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823048]  [] do_exit+0x30b/0xa50
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823053]  [] do_group_exit+0x3f/0xa0
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823059]  [] SyS_exit_group+0x14/0x20
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823065]  [] system_call_fastpath+0x1a/0x1f
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823067] ---[ end trace 04f618100e4ac70d ]---
Jun 12 10:41:25 vochomurka kernel: [  312.823071] perf samples too long (4775 > 2500), lowering kernel.perf_event_max_sample_rate to 50000