Странно, что у вас нет таких папок ... они не занимают много места на компакт-диске. У вас есть эти папки, когда вы создаете нового пользователя?
Чтобы вернуть их, создайте папки с правильными именами, затем перейдите
gedit ~/.config/user-dirs.dirs
Отредактируйте каталоги, добавив или изменение каталогов в наборе, например:
XDG_DOCUMENTS_DIR="$HOME/Documents"