Вероятно, это связано с неправильным набором $ LD_LIBRARY_PATH. Эта переменная среды должна включать путь к библиотеке CUDA. Пример:
setenv QUDA_INSTALL_PATH /usr/local/cuda/lib64 setenv LD_LIBRARY_PATH $QUDA_INSTALL_PATH/lib64:$LD_LIBRARY_PATH