Ошибка: не удалось создать виртуальную машину Java в системе Linux

Я пытаюсь использовать bbmap ( pileup.sh in = my.fa out = new.txt ) для проверки глубины последовательности сборочных каркасов, полученных из операций чтения illumina.

Используя Linux, я установил java jdk, как вы видите:

$ java -version
java version "1.8.0_121"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_121-b13)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.121-b13, mixed mode)

Также я установил модуль bbmap .

Когда я попытался запустить конвейер: pileup.sh in = my.fa out = new.txt , я получил следующую ошибку:

Error occurred during initialization of VM
Unable to allocate 207104KB bitmaps for parallel garbage collection for the requested 6627328KB heap.
Error: Could not create the Java Virtual Machine.
Error: A fatal exception has occurred. Program will exit.

Как исправить эту ошибку?

0
задан 10 July 2020 в 13:41

0 ответов

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: