Окончание хвоста -f после печати n строк

Я вижу, что вы выяснили обходной путь, но что-то, что может быть немного приятнее и элегантнее для вас, - это открыть /home/server/Desktop/minecraft/craftbukkit.sh в текстовом редакторе и добавить:

# before anything is done, probably top of the script (but under the #!/bin/sh)
PWD=$(pwd)  # save the previous location
cd /home/server/Desktop/minecraft
...
...
...
...
# after everything is done, probably near bottom of the script
cd $PWD  # restore the previous location

[d1 ] Если текущий каталог является проблемой (как вы подразумевали в своем решении), это должно позволить вам запускать скрипт из любого места, и он будет работать нормально.