Ну ладно, прочитал и нашел: просто убедитесь, что вы ссылаетесь на quodlibet.desktop в своем mimeapps.list файле (локальная копия в ~/.local/share/applications/mimeapps.list).
Вы можете установить его по умолчанию сразу, указав следующую строку в указанном файле: audio/x-vorbis+ogg=quodlibet.desktop.