Это сообщение означает, что gnome 3 требует, чтобы пакеты работали, что apt-get не может установить, вероятно, потому, что они недоступны в репозиториях по умолчанию. Это имеет смысл, потому что gnome 3 не является рабочим столом ubuntu по умолчанию. Googling around говорит мне, что у вас есть 2 варианта - либо установить ремикс Ubuntu 12.10 ', который поставляется с gnome 3 из коробки, либо самостоятельно установить необходимые пакеты, которые выглядят, но это вопрос добавления некоторых репозиториев. Вот учебник, который я нашел, но не использовал: http://www.webupd8.org/2012/10/how-to-get-complete-gnome-3-desktop-in.html
Если вы просто подменяете шаблоны, я предлагаю sed или perl вместо bash:
sed -e 's/word[0-9]\+word/word125word/g' /home/tomak/test.txt
или
perl -pe 's/word\d+word/word125waord/g' /home/tomak/test.txt