Как версия пакета fglrx связана с номерами версий AMD, такими как Catalyst 12.3?

Вы не установили grub на свой второй hdd (Содержит ubuntu). Просто установите grub на этот hdd. если вам сложно это сделать, просто переустановите ubuntu (убедитесь, что вы выбрали установку grub). И сначала запустите этот hdd.