Я действительно недостаточно разбираюсь в инкапсуляции и аудиоформатах, и я понятия не имею, почему вы хотите что-то сделать и сделать хуже, НО ...
У VLC, похоже, есть
Не полный ответ, но, надеюсь, что-то, чтобы начать вас.