Похоже, вы можете найти решение на форумах Ubuntu здесь; http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=1429439 скачать скрипт python установить предварительные реквизиты,
sudo apt-get install python-tk python-imaging python-imaging-tk
запустить приложение, загрузить файл, выбрать области для обрезки с помощью мыши и нажать go , изображения областей будут сохранены в файл в папке с фотографией. см. ниже:
Просмотр файлов в nautilus