Ключи, загруженные из репозиториев, должны быть объединены в новую комбинацию GPG, поэтому вы можете переместить их в '/etc/apt/trusted.gpg.d/*.gpg', например:
gpg --no-default-keyring --keyring ./Opera.gpg --import Opera.key
sudo cp Opera.gpg /etc/apt/trusted.gpg.d/Opera.gpg