Вы можете восстановить windows mbr, загрузив установочный диск, получив терминал и введите fixmbr (для xp, не знаете, как он находится на vista.)
Я не знаю, можете ли вы переместить его снизу, но в основном вы можете изменить его в правый верхний угол
gconftool-2 --set /apps/metacity/general/button_layout --type string "menu:minimize,maximize,close"
, или вы можете сделать то же самое с gui
gconf-editor /apps/metacity
Вы также можете избежать опции menu.