Мой вопрос: как мне заставить Python использовать мою собственную скомпилированную версию OpenBLAS?
Руководство по установке Theano предполагает, что нужно проверить, что связанные с ним компоненты библиотеки BLAS корректно оптимизируется с помощью следующих команд:
THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=cpu python `python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"`/misc/check_blas.py
THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=gpu python `python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"`/misc/check_blas.py
Результаты:
Карта: GTX 770 Результаты на CPU 0.62s и GPU 0.11sНе уверен, эти результаты были хорошими. Я решил сравнить разные библиотеки, как это сделано в руководстве по установке .
Чтобы проверить последнюю версию, я:
] , клонированный git git clone https://github.com/xianyi/OpenBLAS.git, вошел в каталог и сделал make TARGET=HASWELL (TARGET действительно не требуется, поскольку он автоматически определяет его), а затем make PREFIX=/opt/OpenBLAS install. скопировал файлы под lib (libopenblas.a libopenblas_haswellp-r0.2.14.a libopenblas_haswellp-r0.2.14.so libopenblas.so libopenblas.so.0) к /usr/lib/openblas-haswell_cstm/ добавил альтернативу через sudo update-alternatives --install /usr/lib/libblas.so.3 libblas.so.3 /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 30
К сожалению, это дает ошибку:
$ sudo update-alternatives --config libblas.so.3
There are 4 choices for the alternative libblas.so.3 (providing /usr/lib/libblas.so.3).
Selection Path Priority Status
------------------------------------------------------------
0 /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3 40 auto mode
* 1 /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3 35 manual mode
2 /usr/lib/libblas/libblas.so.3 10 manual mode
3 /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3 40 manual mode
4 /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 30 manual mode
Press enter to keep the current choice[*], or type selection number: 4
update-alternatives: using /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 to provide /usr/lib/libblas.so.3 (libblas.so.3) in manual mode
max@MaxLin:~/tutorials$ python
Python 2.7.8 (default, Oct 20 2014, 15:05:19)
[GCC 4.9.1] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "", line 1, in
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 153, in
from . import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 13, in
from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 18, in
from .polynomial import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/polynomial.py", line 19, in
from numpy.linalg import eigvals, lstsq, inv
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/__init__.py", line 50, in
from .linalg import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/linalg.py", line 29, in
from numpy.linalg import lapack_lite, _umath_linalg
ImportError: /usr/lib/liblapack.so.3: undefined symbol: gotoblas
Я не уверен, что это связано с компилируемой версией, не являющейся версией .so.3. Я попытался использовать libopenblas_haswellp-r0.2.14.so и libopenblas.so, созданный make, но он не влияет на ошибку.