Добавление пользовательских изменений в OpenBlas для Python

Мой вопрос: как мне заставить Python использовать мою собственную скомпилированную версию OpenBLAS?

Фон

Руководство по установке Theano предполагает, что нужно проверить, что связанные с ним компоненты библиотеки BLAS корректно оптимизируется с помощью следующих команд:

THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=cpu python `python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"`/misc/check_blas.py 
THEANO_FLAGS=floatX=float32,device=gpu python `python -c "import os, theano; print os.path.dirname(theano.__file__)"`/misc/check_blas.py

Результаты:

Карта: GTX 770 Результаты на CPU 0.62s и GPU 0.11s

Не уверен, эти результаты были хорошими. Я решил сравнить разные библиотеки, как это сделано в руководстве по установке .

Компиляция и установка OpenBLAS из GitHub

Чтобы проверить последнюю версию, я:

] , клонированный git git clone https://github.com/xianyi/OpenBLAS.git, вошел в каталог и сделал make TARGET=HASWELL (TARGET действительно не требуется, поскольку он автоматически определяет его), а затем make PREFIX=/opt/OpenBLAS install. скопировал файлы под lib (libopenblas.a libopenblas_haswellp-r0.2.14.a libopenblas_haswellp-r0.2.14.so libopenblas.so libopenblas.so.0) к /usr/lib/openblas-haswell_cstm/ добавил альтернативу через sudo update-alternatives --install /usr/lib/libblas.so.3 libblas.so.3 /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 30

К сожалению, это дает ошибку:

$ sudo update-alternatives --config libblas.so.3 
There are 4 choices for the alternative libblas.so.3 (providing /usr/lib/libblas.so.3).

  Selection    Path                                             Priority   Status
------------------------------------------------------------
  0            /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3               40        auto mode
* 1            /usr/lib/atlas-base/atlas/libblas.so.3            35        manual mode
  2            /usr/lib/libblas/libblas.so.3                     10        manual mode
  3            /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3               40        manual mode
  4            /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0   30        manual mode

Press enter to keep the current choice[*], or type selection number: 4
update-alternatives: using /usr/lib/openblas-haswell_cstm/libopenblas.so.0 to provide /usr/lib/libblas.so.3 (libblas.so.3) in manual mode
max@MaxLin:~/tutorials$ python
Python 2.7.8 (default, Oct 20 2014, 15:05:19) 
[GCC 4.9.1] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
  File "", line 1, in 
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 153, in 
    from . import add_newdocs
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 13, in 
    from numpy.lib import add_newdoc
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 18, in 
    from .polynomial import *
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/polynomial.py", line 19, in 
    from numpy.linalg import eigvals, lstsq, inv
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/__init__.py", line 50, in 
    from .linalg import *
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/linalg.py", line 29, in 
    from numpy.linalg import lapack_lite, _umath_linalg
ImportError: /usr/lib/liblapack.so.3: undefined symbol: gotoblas

Я не уверен, что это связано с компилируемой версией, не являющейся версией .so.3. Я попытался использовать libopenblas_haswellp-r0.2.14.so и libopenblas.so, созданный make, но он не влияет на ошибку.

1
задан 13 April 2017 в 15:37

0 ответов

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: