Попробуйте sudo apt-get clean && sudo apt-get update после смены зеркал вашего программного обеспечения :)
Вы можете сделать это с помощью следующей команды:
# rsync --recursive the_file /path/to/your/dir/that/doesn't/exists
cp не имеет опции, которая может сделать этот трюк.