Отредактируйте файл timezone в папке /etc как:
Etc/GMT
Вы можете использовать следующий формат:
Region "/" City
Пример /etc/timezone:
Europe/Athens
или
Europe/Paris
Europe/London
Вы можете поэкспериментировать с: dpkg-reconfigure tzdata и проверить cat файл часового пояса.
Вы должны перезагрузить или запустить снова услугу (а не службу ntp). Я не знаю, какой из них. Если кто-то знает, пожалуйста, поделитесь с нами. (Проверено на Ubuntu 15.10, это изменение учитывается мгновенно)