Перейдите в раздел Система → Администрирование → Менеджер синаптических пакетов.
Выделите установленное ядро и выберите «Пакет → Блокировать версию» в строке меню.
Если по какой-то причине вы по-прежнему получаете запрос для обновления вы можете использовать
sudo aptitude hold <the installed kernel package>
для того же эффекта.
dpkg --set-selections тоже выполняет ту же задачу.