Что означает это терминальное сообщение?

Вы можете использовать команду dpkg для определения пакета, к которому принадлежат файлы

dpkg -S /path/to/file

Например:

$ dpkg -S /usr/sbin/apache2ctl
apache2.2-common: /usr/sbin/apache2ctl

Этот файл принадлежит для упаковки apache2.2-common.