Если вы устанавливаете на раздел FAT32, то для отдельных файлов существует ограничение на максимальный размер 4 ГБ или около того. Таким образом, Wubi разделит установку на 3 виртуальных диска (root.disk, usr.disk, home.disk) в зависимости от размера, который вы хотите. (Макс. 12 ГБ).
К сожалению, 4 ГБ недостаточно для /usr при нормальной установке, так как он быстро растет с течением времени. Лучше всего использовать раздел NTFS, где у вас может быть один root.disk до 30 ГБ или использовать раздел для прямой установки (если у вас есть бесплатный раздел, почему вы все равно используете Wubi? )