Сообщение означает, что cp не скопировал перечисленные каталоги. Это поведение по умолчанию для cp - только файлы копируются обычно, независимо от того, задаете ли вы их явно или используете *. Если вы хотите скопировать каталоги, используйте переключатель -r, что означает «рекурсивный».