Приложения исчезают с панели Gnome после клонирования на машинах с одним и тем же оборудованием

Я клонировал установку Ubuntu на несколько машин, следуя этому руководству. Клонирование работает хорошо. Но если на первоначально установленной машине установлены некоторые установленные приложения, после клонирования клоны не отображают пользовательские приложения на панели gnome. Я частично решил проблему, загрузившись в режим восстановления и выбрав «восстановить поврежденные пакеты». Но у меня медленное подключение к Интернету, и на каждой машине требуется очень много времени. Другим решением было создание ярлыков для этих приложений на рабочем столе на оригинальной машине, которые также появляются на клонированных машинах. Есть ли способ сделать клонированные машины показывать все приложения на панели gnome.