В соответствии с этим ответом (и вы можете найти много других в том же смысле), к сожалению, похоже, нет никакой команды, чтобы позволить единству-приложениям-демону обновить свой кэш приложений. Но я могу подтвердить, что единство автоматически обнаружит любые изменения с .desktop файлами в ~/.local/share/applications. Если эти изменения не будут доступны сразу, попробуйте выполнить регистрацию и снова, чтобы обновить ее.