Попробуйте xmodmap -e "pointer = 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16", который работает для меня.
Flash очень оптимизирован для работы в Linux, но, вероятно, он будет работать в любой ситуации, если у вас есть.
Поэтому я бы рекомендовал переключиться на версию HTML5 для Youtube: http: // www. youtube.com/html5
AND
Также установите виджет частоты процессора: http://www.youtube.com/html5