Значки пользовательских папок Nautilus в / home исчезли, и я не могу их изменить

Это происходит потому, что на Natty Mod4 / Super есть ярлык для панели Unity. Вы можете изменить это на Compiz.

1) Установите Менеджер настроек Compiz

sudo apt-get install compizconfig-settings-manager

2) Откройте:

ccsm  

3) Перейдите в Unity и измените ярлык, как вам нравится освободите свой ярлык:

В этом примере я изменил с Super на Super + L

Теперь ваш ключ мод можно использовать по своему усмотрению.