См. здесь, чтобы отключить программные сокращения Ubuntu программно и только если окна некоторых приложений активны.
В частности, используйте эти значения (предполагая, что вы используете JetBrains Toolbox со стандартным пути установки, в противном случае измените):
apppattern = "JetBrains"
backupfile = "~/.local/share/JetBrains/keymap_backup"
Пока скрипт работает, ярлыки Ubuntu всегда будут работать, кроме когда IDEA и др.
У меня есть набор ярлыков JetBrains, специфичных для здесь ; ввод приветствуется.