Я ожидаю, что это проблемы производительности с NTFS. Разделен ли раздел диска USB с файловой системой NTFS? Как выглядит ваш процессор во время копирования этих файлов?
Если это так, я бы порекомендовал не использовать NTFS на USB-диске, если вам не нужно.
Если у вас есть известная ошибка с NTFS-3G, хотя она не отображает 11.04, как показано на рисунке. Есть комментарий, что кто-то подтвердил это 11.04, но в любом случае некоторым людям повезло с неофициальным PPA, хотя они еще и в пакетах для 11.04.
Другое исправление может существовать, если эта ошибка применяется.