Мне удалось переместить некоторые файлы на внешний диск, удалив их с ПК и выгружая мусор с помощью терминала.
sudo rm -rf ~/.local/share/Trash/*
Использование уменьшено с 98% до 72%.
Я не знаю, действительно ли это помогает, но позже я переведу все документы (/home/username/all-of-this) на внешний диск и снова верну его. Возможно, мои торрент-файлы были разбиты на куски.
Спасибо всем!