Я рад, что вы задали такой вопрос, поскольку он дает возможность прояснить некоторые вещи.
Unity не может напрямую использовать библиотеки GNOME, но опыт, предоставляемый Unity, зависит от платформы GNOME. Если у вас закончилось место в /usr, то, вероятно, вы установили слишком много приложений / библиотек, и пришло время провести аудит.
Что бы я хотел предложить, это поиск любых библиотек / приложений которые автоматически удаляются, а затем ищут приложения, которые вы используете меньше.