Вопросы Теги

OSError: [Errno 2] Нет такого файла или каталога в juncBASE

Сделайте его исполняемым с помощью 

chmod +x filename

и запустите его в терминале с помощью 

./filename

Или

Вы просто 

bash filename
0
задан 18 April 2017 в 10:01

3 ответа

Python не может найти файл, упомянутый. Рассматривая исходный код и руководство, он упоминает следующее:

Возможно, вам потребуется изменить этот файл [IlluminaHBM_2.0_samp2test_bam.txt], чтобы указать полный путь к файлам bam

So в вашем случае вы, возможно, не загрузили тестовые файлы, или вам нужно будет отредактировать IlluminaHBM_2.0_samp2test_bam.txt, чтобы выглядеть примерно так:

kidney /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/kidney.bam breast /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/breast.bam adrenal /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/adrenal.bam colon /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/colon.bam lung /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/lung.bam liver /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/liver.bam
0
ответ дан 18 July 2018 в 14:44

Python не может найти файл, упомянутый. Рассматривая исходный код и руководство, он упоминает следующее:

Возможно, вам потребуется изменить этот файл [IlluminaHBM_2.0_samp2test_bam.txt], чтобы указать полный путь к файлам bam

So в вашем случае вы, возможно, не загрузили тестовые файлы, или вам нужно будет отредактировать IlluminaHBM_2.0_samp2test_bam.txt, чтобы выглядеть примерно так:

kidney /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/kidney.bam breast /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/breast.bam adrenal /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/adrenal.bam colon /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/colon.bam lung /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/lung.bam liver /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/liver.bam
0
ответ дан 24 July 2018 в 20:27
  • 1
    Обновление: моя проблема заключалась в аргументе num_processes Argument, который должен быть 1. – Hassan 10 July 2017 в 21:40

Python не может найти файл, упомянутый. Рассматривая исходный код и руководство, он упоминает следующее:

Возможно, вам потребуется изменить этот файл [IlluminaHBM_2.0_samp2test_bam.txt], чтобы указать полный путь к файлам bam

So в вашем случае вы, возможно, не загрузили тестовые файлы, или вам нужно будет отредактировать IlluminaHBM_2.0_samp2test_bam.txt, чтобы выглядеть примерно так:

kidney /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/kidney.bam breast /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/breast.bam adrenal /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/adrenal.bam colon /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/colon.bam lung /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/lung.bam liver /home/sabah/juncBase/juncBASE_v0.6/liver.bam
0
ответ дан 31 July 2018 в 23:30
  • 1
    Обновление: моя проблема заключалась в аргументе num_processes Argument, который должен быть 1. – Hassan 10 July 2017 в 21:40

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: