Я только что протестировал Acquire :: http :: proxy, который отлично работает (или нет, если прокси-сервер отключен), но: socks: просто идет прямо в сеть, пропуская любой (отсутствующий или нет) прокси.
Таким образом, невозможно использовать apt поверх носков, по крайней мере, на Ubuntu 16.04.2.