e2fsck превратил мой раздел ext4 в ext2 и удалил все мои данные

Deja Dup использует duplicity как бэкэнд, который просто сбой, если бэкэнд-каталог (ваш внешний диск) недоступен. Поскольку логика резервного копирования не находится в Deja Dup, но в двухстороннем порядке, никакая резервная копия не будет пытаться быть создана.

Таким образом, нет потери данных, нет локального загрязнения кэша резервной копии. Если бэкэнд недоступен, не будет попытки проверить данные для резервного копирования.