Ошибка чтения регистра PHYID: ffffff92 при подключении USB

Если файл данных GPS только растет, а не перезаписывается, то вы будете писать одни и те же данные снова и снова, поэтому вы получаете дубликаты.

Вы должны как-то продолжать кормить новые строки awk. Это можно сделать с помощью tail --follow:

tail -f gpsoutput.tr | ./gpsoutput.awk

Тогда ваш gpsoutput.awk будет исполняемым скриптом:

#!/usr/bin/awk -f
BEGIN {
    FS = ",";
}
$1 == "$GPRMC" {
    converted = $8*1.852; 
    print $4, $6 >> "data1.txt";
    printf "%.3f \n", converted >> "speed.txt";
    print $2 >> "gpstime.txt";
    # Optional: add fflush() here.
}