Значительная часть информации, предоставленной в вопросе, а также в принятом ответе, уже недействительна.
Adobe собирается снова поддерживать плагин NPAPI для Linux и делает в настоящее время бета-версию он доступен. Firefox не откажется от поддержки плагина NPAPI Flash. (Они будут, однако, отказаться от поддержки других плагинов NPAPI в марте 2017 года.)Самый простой способ для пользователей Ubuntu получить последнюю версию плагина NPAPI и PPAPI - включить Canonical Partner и установите пакет adobe-flashplugin.
По умолчанию Firefox использует плагин NPAPI. Однако плагин NPAPI не будет иметь всех функций, которые имеет плагин PPAPI. Установив пакет browser-plugin-freshplayer-pepperflash (и перезапустив Firefox), Firefox фактически использует плагин PPAPI.