Связь между сочетанием клавиш и файлом .desktop?

Вы можете использовать опции --include и --exclude или для процесса резервного копирования, который вы, возможно, захотите использовать, --include-from, чтобы вы могли перечислить папки, которые вы хотите создать резервную копию в файле.

[d1 ] Например, ваш файл может быть вызван include.txt и сохранить в вашем домашнем каталоге. Он будет содержать

  inc1/
  inc2/

И команда rsync для резервного копирования папок inc1 и inc2 в вашем домашнем каталоге будет

rsync $HOME --include-from=~/includes.txt /home/backup/

rsync очень гибкая, вам лучше всего справиться сначала на странице man, и если вы застряли, задав более конкретный вопрос.