Как установить XDG_CURRENT_DESKTOP по умолчанию в ubuntu 16?

Кроме того, файлы в вашей домашней папке не исчезнут, поскольку это не файлы установки, а файлы конфигурации. Вы можете удалить все так:

rm -rvf $HOME/.gimp*

И об установке, попробуйте команду autoremove предыдущего ответа.