В целом Ubuntu очень хорошо поддерживает несколько мониторов. Благодаря Gnome даже лучше, чем Windows. Пожалуйста, прочитайте этот пост. Я описал там, как сделать работу (если возможно) двумя VGA-картами. Во всяком случае, я тестировал 10.04 с двумя картами nVidia и тремя мониторами, использующими Xinerama, и он отлично работал.