Проблема с выключением / выключением Ubuntu 16.04

Autoremove не удаляет пакеты, которые могут / должны использоваться в системе.

Удаляет только те сироты, которые были установлены зависимостями других пакетов, которые ранее были удалены.

Итак, вы можете спокойно запустить эту команду и согласиться удалить все, что она предлагает.

В вашем случае вы, вероятно, удалили какой-то главный пакет, который вытащил некоторые другие полезные пакеты.

-install их снова, они никогда не будут затронуты autoremove.