Почему du показывает, что 83GB-файл использует нулевое пространство?
В моем случае это было намного проще, чем некоторые ответы здесь. Я нашел связанную ошибку на панели запуска, и исправление было упомянуто там в комментарии 9:
sudo touch /etc/apparmor.d/local/usr.sbin.mysqld
sudo service apparmor restart