export FLAGS="-f mp4 -O --decomb=bob --loose-anamorphic --modulus 2 -e x264 -q 20 --vfr -E ac3 -6 5point1 -R 48 -B 448 --audio-fallback ac3 --encoder-preset=veryfast --verbose=1"
Работала для меня, спасибо за помощь ребятам, см. скрипт в действии в разделе «Как установить Handbrake и преобразовать рекурсивное дерево файлов