Вы в порядке с Python?
from os import system
lines = open("/home/list/list.txt", 'rb').readlines()
for i in range(0, len(lines)):
currentline = lines[i]
rmcommand = "rm -r " + currentline.strip('\n')
system(rmcommand)
Это займет список, разделит строки на массив, а затем выдает команду для каждого индекса в массиве. [F2] состоит в том, чтобы избавиться от конечного символа новой строки, если он существует.