Новая версия плагина Compiz и Unity имеет серьезные изменения, которые ведут себя по-другому. В моем собственном случае мне пришлось сбросить настройки compiz по умолчанию, чтобы заставить его работать должным образом после обновления до 12.04.
У меня есть карта ATI Radeon HD5750, и я действительно отметил отличное улучшение производительности ( после фиксации compiz) по сравнению с 11.10.