обновление версии R версии 3.3 в ubuntu 16.04
В настоящее время я использую R версию 3.2.3 на Ubuntu 16.04 LTS. Я пытаюсь установить пакет в R, называемый kma, который требует таких пакетов, как devtools, data.table и т. Д. Когда я пытаюсь установить эти пакеты, я получаю следующее:
install.packages(c("devtools", "data.table", "reshape2", "dplyr"))
Warning in install.packages :
download had nonzero exit status
Installing packages into ‘/home/varun/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning in install.packages :
packages ‘devtools’, ‘data.table’, ‘reshape2’, ‘dplyr’ are not available (for R version 3.2.3)
Эти пакеты установлены без каких-либо проблемы, если версия R равна 3,3 или выше. Как я могу обновить свой R до версии 3.3 или выше из текущей версии 3.2. Также все мои пакеты находятся в 3.2. Мне нужно снова установить все эти пакеты?
Надеюсь скоро услышать.
Спасибо
3 ответа
Использовать PPA Майкла Раттера
В PPA Rutter в настоящее время R 3.4.0. Чтобы установить PPA, откройте терминал, нажав Ctrl + Alt + T и введите:
sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter
Далее следуют:
sudo apt update
sudo apt full-upgrade
Это обновит вашу установку R.
Надеюсь, это поможет
Использовать PPA Майкла Раттера
В PPA Rutter в настоящее время R 3.4.0. Чтобы установить PPA, откройте терминал, нажав Ctrl + Alt + T и введите:
sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter
Далее следуют:
sudo apt update
sudo apt full-upgrade
Это обновит вашу установку R.
Надеюсь, это поможет
-
1Привет, я обновил мою версию R до 3.4. Поскольку я запускаю R, используя Rstudio, я пытаюсь установить bioconductor для версии 3.4, но я получаю этот источник ошибок (« bioconductor.org/biocLite.R" ) biononductor URL '. org / biocLite.R & # 39 ;: статус «Сертификат peer не может быть аутентифицирован с данными сертификатами CA». Как я могу это исправить? – user3138373 27 April 2017 в 23:39
-
2@ user3138373 Я понятия не имею о биокондукторе. Это похоже на проблему с их сайтом. Задайте новый вопрос, чтобы другие могли помочь. Если вы удовлетворены моим ответом выше, подумайте о том, чтобы принять ответ как правильный и поставить на него зеленую галочку. Благодарю. – user68186 28 April 2017 в 15:30
-
3Я установил R 3.4 из tarball, но не могу заставить Ubuntu распознавать его ... Я могу следовать этой команде, но предпочел бы просто признать новую установку / не иметь redownload и т. Д. Любые предложения? – Alex W 30 May 2017 в 08:06
-
4Я не уверен, что вы подразумеваете под «Ubuntu, чтобы узнать это». Если вам нужен значок запуска, вам придется это сделать самому. Вот как работает tarball. Они также не обновляются сами по себе. Легче удалить установку и запустить ее снова. Пожалуйста, задайте новый вопрос с более подробной информацией. – user68186 30 May 2017 в 13:06
Использовать PPA Майкла Раттера
В PPA Rutter в настоящее время R 3.4.0. Чтобы установить PPA, откройте терминал, нажав Ctrl + Alt + T и введите:
sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter
Далее следуют:
sudo apt update
sudo apt full-upgrade
Это обновит вашу установку R.
Надеюсь, это поможет
-
1Привет, я обновил мою версию R до 3.4. Поскольку я запускаю R, используя Rstudio, я пытаюсь установить bioconductor для версии 3.4, но я получаю этот источник ошибок (« bioconductor.org/biocLite.R" ) biononductor URL '. org / biocLite.R & # 39 ;: статус «Сертификат peer не может быть аутентифицирован с данными сертификатами CA». Как я могу это исправить? – user3138373 27 April 2017 в 23:39
-
2@ user3138373 Я понятия не имею о биокондукторе. Это похоже на проблему с их сайтом. Задайте новый вопрос, чтобы другие могли помочь. Если вы удовлетворены моим ответом выше, подумайте о том, чтобы принять ответ как правильный и поставить на него зеленую галочку. Благодарю. – user68186 28 April 2017 в 15:30
-
3Я установил R 3.4 из tarball, но не могу заставить Ubuntu распознавать его ... Я могу следовать этой команде, но предпочел бы просто признать новую установку / не иметь redownload и т. Д. Любые предложения? – Alex W 30 May 2017 в 08:06
-
4Я не уверен, что вы подразумеваете под «Ubuntu, чтобы узнать это». Если вам нужен значок запуска, вам придется это сделать самому. Вот как работает tarball. Они также не обновляются сами по себе. Легче удалить установку и запустить ее снова. Пожалуйста, задайте новый вопрос с более подробной информацией. – user68186 30 May 2017 в 13:06