Скрипт для создания туннеля SSH, а затем запустить другую программу, использующую туннель

Процесс получения пакета в Debian описан в этом FAQ. Как только ваш пакет находится в Debian, он будет автоматически импортирован в Ubuntu.

Debian и Ubuntu используют ту же систему упаковки. Двоичные пакеты (файлы .deb) для Debian и Ubuntu не обязательно совместимы, но когда вы загружаете Ubuntu и Debian, вы загружаете исходный код, чтобы он был создан для разных архитектур. Двоичные пакеты создаются отдельно для Debian и Ubuntu.

Не имеет значения, где вы размещаете свой код.